Si has usado un plugin que te crea shortcodes y lo has usado en varias de tus entradas o páginas, entonces al desactivar el plugin tendrás tu contenido mezclado con los shortcodes (sin interpretar), en este artículo veremos cómo ocultar estos shortcodes que no usas.
Generalidades
En la siguiente imagen vemos un ejemplo de cómo al desactivar un plugin su shortcode se ha quedado huérfano y sin interpretar y se muestra como parte del contenido. Esto es perjudicial para la experiencia de usuario, pero también lo es para nuestro SEO.

Si tienes shortcodes huérfanos de plugins que ya no usas, una opción sería que manualmente vayas borrando cada uno de estos shortcodes, sin embargo esto se te puede complicar si tienes muchas entradas y páginas en donde aparece el shortcode.
Eliminar el shortcode
Lo ideal sería que se elimine directamente de la base de datos, sin embargo si quieres evitar complicaciones la manera más sencilla es ocultarlo usando el siguiente código:
add_shortcode( 'shortcode', '__return_false' );
En el código anterior tienes que reemplazar shortcode por el nombre de tu shortcode, en nuestro ejemplo sería otw_shortcode_button, puedes agregar este código al final de tu archivo functions.php de tu theme.
Si tienes MySQL 8.0+ puedes evaluar usar una consulta SQL con la función REGEXP_REPLACE que te permite buscar y reemplazar con una expresión regular.
Conclusión
Usando el código anterior, eliminamos el shortcode del front-end del sitio, evitas el uso de un plugin para hacer esto, aunque la eliminación sólo se da en el front-end del sitio ya que el código del shortcode aún permanecerá como parte de tu contenido en la base de datos.
¿Aún con dudas?, en el siguiente video se detalla los puntos anteriores